眼见凤山门被攻破，刘之源瞬间明白了情况的严重性，他顾不得附近的这支明军，决定冒险留下部分兵马拦截这支明军，自己率领主力冒险驰援凤山门，意图趁明军只有少量入城之时将其反推回去。
于是，刘之源留下了部分人马继续堵住街角，自己带着大部分朝着凤山门跑去，说是大部队，其实他能够带走的也只有一千多人而已。
凤山门，在城门被攻破，大明军旗插在城头上之后，苏辞便下令全军入城，随后兵分两路，一路继续向城内推进，一路支援侯潮门，配合鲁王军攻占城门迎接友军入城。
可就在大军还没完全入城之时，城内的先头部队与刘之源率领的清军遭遇，双方随即爆发激战，双方的鸟铳手、弓手隔着几十米的街道相互对射，弹丸、箭簇在半空擦身而过，随后落入人群之中，一方射击另外一方都会惨叫着倒下数十人。
双方对射了一阵，还是清军先受不了，丢下了阵前的数十具尸体撤了回去，由手持刀盾和长矛的步卒顶了上去，呐喊着发起冲锋，明军鸟铳手又打出一轮齐射射杀数人后连忙撤下来，将战场留给双方的近战步兵。
另一边，被刘之源堵在街道上的陈新友等人也发现了清军分兵的事情，两人便决定主动出击断绝清军后路，明军随即冲出街角，向大道上列阵的清军发起进攻，那清军只来得及打出一轮齐射，就被举盾冲锋的陈新友部冲到了脸上，双方鏖战在一起。
而在同时，高凡也率领神机营向凤山门方向跑去，意图从清军的后背发起进攻，与前面的友军夹击清军，一时间，凤山门外喊杀声震天，枪声连天，居住在这一片的百姓听着外面的动静只能躲在床铺底下，瑟瑟发抖，祈祷外面激战的官兵不会冲进他们家。
凤山门被突破的消息很快就被传到了离凤山门并不算远的侯潮门，但令人遗憾的是，与凤山门沦陷的消息一同到来的还有身着红色战袍的明军——这些明军突然出现在侯潮门守军的侧翼，等后者反应过来的时候已经为时已晚，明军只杀死了数十人，这里的清军就直接丢盔弃甲，转身逃进了城内，将城门的控制权留给了出现在城内的明军。
随后，这伙明军从内部打开侯潮门，迎接城外的鲁王军入城，即便是身为文官，张煌言仍然身先士卒，与张名振一同率先冲入城内，两军合兵一处，朝着城中杀去。
凤山门这里，即便有固山额真刘之源亲自坐镇，清军在腹背受敌的情况下还是节节败退，看着己方不断倒下的士兵，刘之源的肠子都快悔青了，他怎么也想不到凤山门的守军溃败的速度这么快，完全撑不到援军抵达一块将明军赶出去。
刘之源看着身前身后不断推进的明军，心中被悔恨与绝望的情绪充斥着，绝望之下，他趁着亲兵不注意的时候举刀自刎，锋利的刀刃直接划开了脆弱的咽喉，鲜血喷涌而出，等亲兵反应过来时他的身体已经摇晃了一下从马背上栽倒了下去。
刘之源的自刎直接导致这伙原本还可以负隅顽抗的清军军心彻底溃散，失去了主心骨的清军面对身前身后杀气腾腾的明军，最终只能绝望地放下武器，跪地投降，成为明军的俘虏。
城南明军自此全面入城，苏辞命人将那些投降的清军带到城外的营地看守后，又与神机营和陈新友汇合，与张名振部兵分两路继续朝城内推进，不过苏辞的目标和张名振不同，他要去与苏言汇合，最起码也要确认苏言的安全。
与此同时，苏言还在总督部院外与李率泰的八旗军对峙着，后者在几次进攻皆受挫后，不得不改变战术，意图从另一条街口发起进攻，但从这边进攻的八旗军再次遭到了线列步兵的齐射，丢下数十具尸体狼狈撤退。
几次进攻都受挫，李率泰只能停止进攻，继续与明军对峙，在进攻的同时他就已经派出多名使者前往城东的几个没有爆发战斗的城门往城内调兵，并命令使者前去城南城北两处战场希望能够得到最新的军情，钱塘门和武林门两处明军的攻势并不猛烈，清军还是能够游刃有余地应对。
但陈泰并不认为事情有这么简单，虽然他还不知道清波门和凤山门的战况，但他敏锐地推测钱塘门与武林门外的明军很有可能只是佯攻而已，明军真正的主攻战场是在凤山门或者城东几门之中，但城东几门都没有动静，因此他认为明军的主力在凤山门外。
不过陈泰还是猜错了，在他见到李率泰的使者，并从后者口中得知明军从清波门入城后，他就知道杭州城守不下去了，杭州城如此之大，清军哪怕有一万六千余人也要分兵到各个城门把守，眼下明军从清波门入城，想要调集重兵前去镇压完全是痴人说梦。
等城内清军集结起来前去镇压入城明军的时候，明军速度快点早就拿下了临近的城门，甚至都让主力进城了。
陈泰虽然明白这件事，但他并不能直接说出来，现在说出来就是扰乱军心，他只能提前做好应对措施，让自己的亲兵备好马匹和干粮——他准备再上演一次狼狈出逃了。
正如陈泰料想的一般，在凤山门与侯潮门被拿下后，明军大举入城，奉李率泰之命离开城门入城抵抗明军的清军在与明军接触后，自发依托街巷抵抗明军攻势，与其展开巷战。
在与张名振二人率领的鲁王军交战时，清军还能和他们打得有来有回，甚至隐隐占据了上风，可在与苏言麾下的兵马交战后，清军非但占不到任何便宜，还被打得节节败退，两军差异由此可见一斑。
向苏言靠拢的苏辞部在击溃了一支不知道从哪冒出来的清军后，终于被李率泰发现，李率泰生怕这支新的明军的战斗力和眼前对峙的明军一样高昂，也不敢留下恋战，连忙率领部下撤往满城，意图依靠满城的城墙固守。
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